空气微生物采样器按采样原理不同大致可分为：过滤式、撞击式、离心式和液体冲击式采样器。都必须吸引空气进入采样器，才能收集空气微生物。
空气微生物采样器对微生物的分析方法有两大类：
培养方法是将采集到的活的空气微生物，在半固态的营养培养基上经过培养繁殖生成菌落，用目视鉴别和计数，其结果用菌落数表示。用培养方法分析样品，必须根据采样目的和空气环境类型，选择适当的采样时间，使每一个样品都收集到足够的带菌粒子是非常重要的，以保证采样结果在统计学上具有显著性和代表性。因为塑料培养皿上的静电电荷的吸附作用，在撞击式采样器中，使用塑料培养皿会引起收集效率降低20％，所以一般应选用标准玻璃培养皿。
非培养直接计数方法 非培养直接计数方法是在采样后的样品不经过培养就可进行微生物鉴别和计数的方法，不要求微生物能否培养，所有的微生物粒子，包括死的或活的，凡是使人致病的全部微生物粒子都应当计数。因此，直接计数方法测出来的微生物数量往往比培养方法的高得多。
空气微生物采样器采样具体步骤：
安装与消毒 将选择好的滤膜安装在采样夹里，并认真检查安装是否合乎要求，然 后用紫外线(UV)将滤膜和采样夹进行消毒。
进行采样 过滤式空气采样器的空气采样流量准确程度直接影响采样结果，在采样 前应用皂膜流量计校准采样泵的流量。将采样夹用真空管与便携式恒流采样泵连接，启动采 样泵进行采样。
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